克什米尔情况很特殊，它处于印度与巴基斯坦之间，“地理因素”的考虑在这里不起作用。而克什米尔的王公是印度教徒，但居民中将近80%却是穆斯林。按照分治方案中多数决定原则，应该归入巴基斯坦；但按照土邦的王公决定原则，显然印度会被优先考虑。因此印巴分治时，克什米尔的归属问题未能得到解决。
之后，印巴之间爆发了三次战争。1948年到1949年的第一次印巴战争的结果是，印度控制了克什米尔地区大约2/3的土地与3/4的人口。巴基斯坦控制了另外1/3的土地与1/4人口。这次停火奠定了后来双方对克什米尔控制的范围。另外，按照联合国的决议，克什米尔的归属问题最终必须由公民投票来决定。但是，双方后来在是否举行、如何举行公民投票的问题上始终无法取得统一意见。通过一步步的行动，印度到六十年代初期已经完全接管了克什米尔。
